Viện Xã hội học Hoàng gia Séc, nghiên cứu cả khoa học tự nhiên và con người, được khởi công ở Séc năm 1784. Sau khi chế độ Cộng sản lên nắm quyền ở Tiệp Khắc vào năm 1948, tất cả các nhà khoa học, các học viện phi đại học và xã hội học bị giải thể và trong thời gian đó, Viện Hàn lâm Khoa học Tiệp Khắc ra đời. Viện thực hiện cả nghiên cứu khoa học phức tạp và xã hội học. Viện luôn trong tình trạng bị áp lực tư tưởng cho đến khi chế độ Cộng sản sụp đổ năm 1989. Năm 1992, Viện Hàn lâm Khoa học Séc được thành lập theo điều khoản số 283/1992.